در میکروسکوﭖ الکترونی عبوری به جای ﭘرتو نور از ﭘرتو الکترون استفاده می شود به طوری که ﭘرتو الکترونی شتاب داده شده از یک نمونه بسیار بسیار نازک عبور کرده و تصویری با بزرگنمایی بسیار بالا تشکیل می شود.
قابلیت و کاربردها:
تصویر برداری از نمونه های برش گیری شده با دستگاه اولترامیکروتوم با بزرگنمایی بسیار بالا تا ٥٠٠٠٠٠ برابر
تعیین مورفولوﮊی و اندازه ذرات نمونه های مختلف زیستی، ﭘلیمری, نانوذرات فیلم های نازک و غیره
تصویربرداری از ساختارهای درونی مواد و اجزای درون سلولی بافت های جانوری، گیاهی و میکروبی